Para saber el espacio total ocupado de una carpeta (y todas las subcarpetas que hayan dentro) utilizaremos el comando du.
du -hlsc CARPETA
En lugar de "CARPETA" hay que indicar el directorio que queremos saber su tamaño. Si hay muchos archivos y subdirectorios dentro el proceso puede demorarse varios minutos, así que tened paciencia.
Desde el siguiente enlace podéis saber más acerca de este comando.
Suspender un dominio en Plesk
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Cómo buscar ficheros mayores de un tamaño en Linux con el comando FIND
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